A Mata Atlântica é um dos hotspots de biodiversidade mais ricos e ameaçados do mundo, com altos níveis de endemismo em plantas e animais.
Plantas endêmicas (exemplos)
Bromélias e orquídeas com altos índices de endemismo (centenas de espécies únicas).
Mamíferos endêmicos
Ouriço-preto (Chaetomys subspinosus) — roedor raro da família dos ouriços, exclusivo da Mata Atlântica do Nordeste ao Sudeste brasileiro.
Tamanduá-bandeira-do-norte / preguiça-de-coleira (Bradypus torquatus e B. crinitus) — preguiças com distribuição restrita ao bioma.
Mico-leão-dourado (Leontopithecus rosalia) — icônico primata endêmico da Mata Atlântica fluminense. (amplamente conhecido; referência geral ao bioma)
Aves endêmicas
Saíra-apunhalada (Nemosia rourei) — espécie criticamente ameaçada da Mata Atlântica.
Diversas araras, papagaios e passarinhos com distribuição restrita ao bioma (ex.: Amazona brasiliensis, Amazona rhodocorytha).
Répteis / Anfíbios
Grande número de anfíbios altamente endêmicos, incluindo grupos inteiros de pequenos sapos e rãs.
Cerca de 60 espécies de répteis endêmicos.
Peixes de água doce
Cerca de 133 espécies de peixes de água doce endêmicas.
Resumo de números estimados (Mata Atlântica):
~8.000 plantas endêmicas
~73 mamíferos
~181 aves
~60 répteis
~253 anfíbios
*(Depende de levantamento, mas mostra alto endemismo) *
CERRADO (hotspot reconhecido):
O Cerrado é a savana tropical mais biodiversa do mundo, com milhares de espécies endêmicas de plantas e dezenas de espécies animais com distribuição restrita ao bioma.
Plantas endêmicas
Buriti (Mauritia flexuosa) — palmeira típica de veredas do Cerrado.
Pequi (Caryocar brasiliense) — árvore frutífera típica.
Salacia crassifolia — arbusto endêmico com frutos comestíveis.
Animais endêmicos (exemplos)
Lagarto Enyalius capetinga — espécie de lagarto endêmica do Cerrado.
Diversas aves endêmicas — estatísticas estimam cerca de 20–29 aves endêmicas no bioma.
Morcegos, insetos e pequenos répteis com endemismos locais que ainda estão sendo descritos.
Observação: muitos grupos de invertebrados (especialmente insetos) têm centenas a milhares de espécies endêmicas, muitas ainda não formalmente descritas.
CAATINGA (bioma exclusivo do Brasil)
A Caatinga possui um grande número de espécies endêmicas, especialmente na flora, mas ainda é menos estudada comparada ao Cerrado ou Mata Atlântica.
Plantas endêmicas
Estima-se que mais de 1.500 espécies de plantas são endêmicas da Caatinga, adaptadas a clima semiárido.
Animais endêmicos
Répteis e anfíbios com áreas de distribuição restrita à Caatinga (ex.: espécies de lagartos e sapos locais). (Exemplos específicos ainda em estudos taxonômicos e coleções científicas.)
FERNANDO DE NORONHA (ilhas oceânicas)
As ilhas oceânicas de Fernando de Noronha formam um ambiente isolado com espécies endêmicas insulares, particularmente aves e répteis.
Aves endêmicas
Noronha elaenia (Elaenia ridleyana) — passeriforme vulnerável endêmico ao arquipélago.
Noronha vireo (Vireo gracilirostris) — outra ave endêmica de Noronha.
Répteis endêmicos
Noronha skink (Trachylepis atlantica) — lagarto endêmico do arquipélago.
Cuidado: outras espécies em Fernando de Noronha podem ser introduzidas ou invasoras (não endêmicas) e ameaçar a fauna local.
Notas adicionais importantes
Muitas espécies endêmicas também estão ameaçadas de extinção por perda de habitat, fragmentação e mudanças ambientais.
O Brasil abriga dezenas de milhares de espécies endêmicas de plantas e animais em seus biomas, com números variando conforme grupos taxonômicos.
A Mata Atlântica e o Cerrado têm particularmente altos índices de endemismo em plantas e vertebrados; a Caatinga e as ilhas têm endemismos notáveis, mas menos estudados.

Espécies endêmicas ou fortemente representativas das áreas de biodiversidade que você mencionou — Mata Atlântica, Cerrado, Caatinga e o arquipélago de Fernando de Noronha — com exemplos importantes de fauna e flora endêmicas.
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